வரதராஜ பெருமாள் கோயில் என்பது இந்தியா தீபகற்பத்தில் புதுச்சேரி மாநிலத்தின் வில்லியனூர் புறநகர்ப் பகுதியில் அமைந்துள்ள ஒரு பெருமாள் கோயில் ஆகும். இக்கோயில் ஆயிரம் ஆண்டுகள் தொன்மை வாய்ந்தது.